# # From Appendix 2 of the Genepop manual Version 3.3, March 2001 # # The following example (due to A.J. Gharrett) illustrates the results # obtained by the different methods for the data shown on next page. # # Estimate Fis Fst Fit # -------------------------------- -------- ------- ------- # Loc1 -0.0483 0.5712 0.5505 # Loc2 -0.1161 0.8560 0.8393 # Loc3 0.0051 -0.0023 0.0028 # Multilocus (1984 a,b,c method) -0.0286 0.5606 0.5480 # Multilocus (1996 S1,S2,S3 method) -0.0286 0.5633 0.5508 # Multilocus (Genepop v3.3) -0.0275 0.5436 0.5310 # # Most of the time the different estimators yield close values. # set loc pop cat 1=PopI 2=PopJ 3=PopK set loc Loc1 mar set loc Loc2 mar set loc Loc3 mar read ped inline PopI 0001 x x x 1 01/01 01/01 01/01 PopI 0002 x x x 1 01/01 01/01 01/01 PopI 0003 x x x 1 01/01 01/01 01/01 PopI 0004 x x x 1 01/01 01/01 01/01 PopI 0005 x x x 1 01/01 01/01 01/01 PopI 0006 x x x 1 01/01 01/01 01/01 PopI 0007 x x x 1 01/01 01/01 01/01 PopI 0008 x x x 1 01/01 01/01 01/01 PopI 0009 x x x 1 01/02 01/02 01/01 PopI 0010 x x x 1 01/02 01/02 01/01 PopI 0011 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0012 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0013 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0014 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0015 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0016 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0017 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0018 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0019 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0020 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0021 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0022 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0023 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0024 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0025 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0026 x x x 1 01/01 01/01 01/02 PopI 0027 x x x 1 01/02 01/02 01/02 PopI 0028 x x x 1 01/02 01/02 01/02 PopI 0029 x x x 1 01/02 01/02 01/02 PopI 0030 x x x 1 01/02 01/02 01/02 PopI 0031 x x x 1 01/01 01/01 02/02 PopI 0032 x x x 1 01/01 01/01 02/02 PopI 0033 x x x 1 01/01 01/01 02/02 PopI 0034 x x x 1 01/01 01/01 02/02 PopI 0035 x x x 1 01/01 01/01 02/02 PopI 0036 x x x 1 01/01 01/01 02/02 PopI 0037 x x x 1 01/01 01/01 02/02 PopI 0038 x x x 1 01/01 01/01 02/02 PopI 0039 x x x 1 01/02 01/02 02/02 PopI 0040 x x x 1 01/02 01/02 02/02 PopI 0041 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0042 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0043 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0044 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0045 x x x 1 01/01 x/x 01/01 PopI 0046 x x x 1 01/01 x/x 01/01 PopI 0047 x x x 1 01/01 x/x 01/01 PopI 0048 x x x 1 01/01 x/x 01/01 PopI 0049 x x x 1 01/02 x/x x/x PopI 0050 x x x 1 01/02 x/x 01/01 PopI 0051 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0052 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0053 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0054 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0055 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0056 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0057 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0058 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0059 x x x 1 01/01 x/x 01/02 PopI 0060 x x x 1 01/01 x/x 01/02 PopI 0061 x x x 1 01/01 x/x 01/02 PopI 0062 x x x 1 01/01 x/x 01/02 PopI 0063 x x x 1 01/01 x/x 01/02 PopI 0064 x x x 1 01/01 x/x 01/02 PopI 0065 x x x 1 01/01 x/x 01/02 PopI 0066 x x x 1 01/01 x/x 01/02 PopI 0067 x x x 1 01/02 x/x x/x PopI 0068 x x x 1 01/02 x/x x/x PopI 0069 x x x 1 01/02 x/x 01/02 PopI 0070 x x x 1 01/02 x/x 01/02 PopI 0071 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0072 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0073 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0074 x x x 1 01/01 x/x x/x PopI 0075 x x x 1 01/01 x/x 02/02 PopI 0076 x x x 1 01/01 x/x 02/02 PopI 0077 x x x 1 01/01 x/x 02/02 PopI 0078 x x x 1 01/01 x/x 02/02 PopI 0079 x x x 1 01/02 x/x x/x PopI 0080 x x x 1 01/02 x/x 02/02 PopJ 0001 x x x 2 02/02 01/02 01/01 PopJ 0002 x x x 2 02/02 01/02 01/01 PopJ 0003 x x x 2 01/02 02/02 01/01 PopJ 0004 x x x 2 02/02 02/02 01/01 PopJ 0005 x x x 2 02/02 02/02 01/01 PopJ 0006 x x x 2 02/02 02/02 01/01 PopJ 0007 x x x 2 02/02 02/02 01/01 PopJ 0008 x x x 2 02/02 02/02 01/01 PopJ 0009 x x x 2 01/02 01/02 01/02 PopJ 0010 x x x 2 02/02 01/02 01/02 PopJ 0011 x x x 2 02/02 01/02 01/02 PopJ 0012 x x x 2 02/02 01/02 01/02 PopJ 0013 x x x 2 02/02 01/02 01/02 PopJ 0014 x x x 2 01/02 02/02 01/02 PopJ 0015 x x x 2 01/02 02/02 01/02 PopJ 0016 x x x 2 01/02 02/02 01/02 PopJ 0017 x x x 2 02/02 02/02 01/02 PopJ 0018 x x x 2 02/02 02/02 01/02 PopJ 0019 x x x 2 02/02 02/02 01/02 PopJ 0020 x x x 2 02/02 02/02 01/02 PopJ 0021 x x x 2 02/02 02/02 01/02 PopJ 0022 x x x 2 02/02 02/02 01/02 PopJ 0023 x x x 2 02/02 02/02 01/02 PopJ 0024 x x x 2 02/02 02/02 01/02 PopJ 0025 x x x 2 02/02 02/02 01/02 PopJ 0026 x x x 2 02/02 02/02 01/02 PopJ 0027 x x x 2 02/02 02/02 01/02 PopJ 0028 x x x 2 02/02 02/02 01/02 PopJ 0029 x x x 2 01/02 01/02 02/02 PopJ 0030 x x x 2 02/02 01/02 02/02 PopJ 0031 x x x 2 02/02 01/02 02/02 PopJ 0032 x x x 2 01/02 02/02 02/02 PopJ 0033 x x x 2 01/02 02/02 02/02 PopJ 0034 x x x 2 02/02 02/02 02/02 PopJ 0035 x x x 2 02/02 02/02 02/02 PopJ 0036 x x x 2 02/02 02/02 02/02 PopJ 0037 x x x 2 02/02 02/02 02/02 PopJ 0038 x x x 2 02/02 02/02 02/02 PopJ 0039 x x x 2 02/02 02/02 02/02 PopJ 0040 x x x 2 02/02 02/02 02/02 PopK 0001 x x x 3 01/01 03/03 01/01 PopK 0002 x x x 3 01/01 03/03 01/01 PopK 0003 x x x 3 01/01 03/03 01/01 PopK 0004 x x x 3 01/02 03/03 01/01 PopK 0005 x x x 3 01/02 03/03 01/01 PopK 0006 x x x 3 01/02 03/03 01/01 PopK 0007 x x x 3 01/02 03/03 01/01 PopK 0008 x x x 3 01/02 03/03 01/01 PopK 0009 x x x 3 01/02 03/03 01/01 PopK 0010 x x x 3 02/02 03/03 01/01 PopK 0011 x x x 3 02/02 03/03 01/01 PopK 0012 x x x 3 02/02 03/03 01/01 PopK 0013 x x x 3 01/01 03/03 01/02 PopK 0014 x x x 3 01/01 03/03 01/02 PopK 0015 x x x 3 01/01 03/03 01/02 PopK 0016 x x x 3 01/01 03/03 01/02 PopK 0017 x x x 3 01/01 03/03 01/02 PopK 0018 x x x 3 01/02 03/03 01/02 PopK 0019 x x x 3 01/02 03/03 01/02 PopK 0020 x x x 3 01/02 03/03 01/02 PopK 0021 x x x 3 01/02 03/03 01/02 PopK 0022 x x x 3 01/02 03/03 01/02 PopK 0023 x x x 3 01/02 03/03 01/02 PopK 0024 x x x 3 01/02 03/03 01/02 PopK 0025 x x x 3 01/02 03/03 01/02 PopK 0026 x x x 3 01/02 03/03 01/02 PopK 0027 x x x 3 01/02 03/03 01/02 PopK 0028 x x x 3 02/02 03/03 01/02 PopK 0029 x x x 3 02/02 03/03 01/02 PopK 0030 x x x 3 02/02 03/03 01/02 PopK 0031 x x x 3 02/02 03/03 01/02 PopK 0032 x x x 3 02/02 03/03 01/02 PopK 0033 x x x 3 01/01 03/03 02/02 PopK 0034 x x x 3 01/01 03/03 02/02 PopK 0035 x x x 3 01/02 03/03 02/02 PopK 0036 x x x 3 01/02 03/03 02/02 PopK 0037 x x x 3 01/02 03/03 02/02 PopK 0038 x x x 3 01/02 03/03 02/02 PopK 0039 x x x 3 02/02 03/03 02/02 PopK 0040 x x x 3 02/02 03/03 02/02 ;;;; run llm pop Loc1 llm pop Loc1 pop*Loc1 lrt fst pop ass pop cat