# # This data set distributed with the R gap package # contains eight ALDH2 markers and Japanese alcoholic patients and controls. # Source: # Prof Ian Craig of Oxford and SGDP Centre, KCL # References: # Koch HG, McClay J, Loh E-W, Higuchi S, Zhao J-H, Sham P, Ball D, # et al (2000) Allele association studies with {SSR} and {SNP} # markers at known physical distances within a 1 Mb region # embracing the {ALDH2} locus in the Japanese, demonstrates linkage # disequilibrium extending up to 400 kb. Hum. Mol. Genet. # 9:2993-2999 # EXON12 == rs671 E487K ALDH2*2 # EXON1 == rs6490301 # # set locus alcoholism affection . set locus D12S2070 marker 114.567092 114567092 chr:12 set locus D12S839 marker 113.955707 113955707 chr:12 set locus D12S821 marker 111.459825 111459825 chr:12 set locus D12S1344 marker 110.809882 110809882 chr:12 set locus EXON12 marker 110.726149 110726149 chr:12 ALDH2(2) set locus EXON1 marker 110.689178 110689178 chr:12 set locus D12S2263 marker 110.687106 110687106 chr:12 set locus D12S1341 marker 113.575257 113575257 chr:12 read cases inline 2 y 4 4 3 4 3 7 8 10 2 2 2 2 6 8 5 8 4 y 4 4 4 5 5 6 3 4 2 2 2 2 8 9 3 5 6 y 4 4 3 5 3 5 3 8 2 2 2 2 7 10 8 8 12 y 4 4 4 5 3 4 8 8 2 2 0 0 6 7 5 7 13 y 4 4 5 5 5 6 3 3 2 2 2 2 9 9 6 6 14 y 1 5 5 5 3 5 10 10 2 2 2 2 6 8 4 5 15 y 2 5 4 5 3 3 8 8 2 2 2 2 7 8 7 8 16 y 2 2 5 5 3 3 3 8 2 2 2 2 2 8 3 8 17 y 2 2 4 4 3 5 3 8 2 2 2 2 8 8 4 5 19 y 2 5 3 4 6 8 2 3 2 2 2 2 7 10 1 3 20 y 4 4 4 4 3 9 8 13 2 2 2 1 5 8 5 7 21 y 4 5 4 4 0 0 3 8 2 2 2 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